Сегодня предприятие специализируется на выпуске галено-фармацевтических препаратов – настоек, жидких экстрактов из лекарственного растительного сырья, растворов, жидких лекарственных смесей, спиртов, сиропов, масел, мазей и линиментов. Среди них большая группа сердечно-сосудистых препаратов (капли Зеленина, ландышево-валериановые, ландышево-пустырниковые, корвалол, настойка боярышника, ландыша, плёнки «Тринитролонг»). Значительное место занимают препараты антисептического действия, болеутоляющие, общеукрепляющие, тонизирующие и другие, достаточно эффективные и доступные по цене лекарственные средства.
Всего в ассортименте фабрики более 80 наименований лекарственных средств, официально разрешённых к применению в медицинской практике. Все они используются в лечебно-профилактических учреждениях и отпускаются из аптек, в основном, без рецепта врача.
В соответствии с требованиями «Закона о лекарственных средствах» упаковка готовой продукции производится в индивидуальную картонную пачку. Каждая единица выпускаемой продукции снабжается инструкцией по применению, утверждённой Фармакологическим комитетом.
На предприятии освоен выпуск сухих лекарственных форм в пакетах термосвариваемых.
Продукция ЗАО «Ярославская фармацевтическая фабрика» ежегодно выставляется на выставке «Аптека» в г. Москва, а также в постоянно действующей выставке товаров в ЦНТИ города Ярославля.
Весь ассортимент выпускаемой продукции представлен в аптеке ЗАО «Ярославская фармацевтическая фабрика», расположенной на улице Суркова, д.1/6 по отпускным ценам фабрики.
Всё большее внимание на предприятии уделяется качеству выпускаемой продукции. Для оценки качества продукции оснащено и аккредитовано две лаборатории — аналитическая и микробиологическая. С 1999 года в соответствии с «Законом о лекарственных средствах» каждая серия выпускаемой продукции проходит обязательный контроль и сертификацию в региональных Центрах контроля качества лекарственных средств.
Общее состояние производства лекарственных средств и соответствие его необходимым требованиям подтверждается периодическими проверками и лицензией на производство лекарственных препаратов Федеральных Органов Здравоохранения.
В 2005 году система менеджмента качества предприятия успешно прошла проверку на соответствие требованиям стандарта ГОСТ Р ИСО 9000-2001.
В мае 2006 года проверка аудиторами AFAQ показала ,что Система Менеджмента Качества ЗАО «ЯФФ» соответствует требованиям международного стандарта ISO 9001:2000
Нашими партнёрами по продаже лекарственных препаратов являются крупные фармацевтические компании во всех регионах российской федерации. С целью расширения рынка сбыта менеджеры предприятия проводят работу по продвижению выпускаемых лекарственных препаратов на рынки Зарубежных государств. Регулярно осуществляются поставки лекарственных препаратов в Белоруссию.
Ряд препаратов прошёл регистрацию в Грузии.